Кофактор быстро выводит на рынок прогностический тест на иммунотерапию, используя данные межгорного отвода

НЬЮ-ЙОРК – После объявления о сотрудничестве с Culmination Bio, дочерней компанией Intermountain Health, в начале этой недели компания Cofactor Genomics «активно движется» к продвижению своего теста OncoPrism, позволяющего прогнозировать, принесет ли пациентам с различными видами рака пользу иммунотерапия.

Компания Cofactor из Сан-Франциско валидировала OncoPrism, тест подтипирования Т-клеток и количественного определения иммунных клеток на основе секвенирования РНК, в рамках исследования PREDAPT с использованием обезличенных образцов опухолей и сопоставленных клинических данных. Цель, по словам генерального директора Cofactor Джаррета Гласскока, состоит в том, чтобы продвигать OncoPrism как инструмент для определения того, какие пациенты с наибольшей вероятностью будут реагировать на ингибиторы контрольных точек PD-1/L1, такие как Кейтруда (пембролизумаб) компании Merck или Опдиво (ниволумаб) компании Bristol Myers Squibb.

В обсервационном проспективном исследовании планируется принять участие 1650 пациентов с 11 типами рака. Но новое партнерство Culmination также является ключом к валидации теста, сказал Гласскок, поскольку оно дает Cofactor доступ к базе данных из 4,5 миллионов образцов пациентов, каждый из которых соответствует данным продольных клинических результатов, а также полногеномному, транскриптомному, экзомному секвенированию, протеомике и т.д. и другие омические анализы.

Этот кладезь данных, который Culmination называет своей аналитической платформой Culmination, предлагается таким партнерам, как Cofactor. Хотя проспективная валидация OncoPrism с использованием образцов, собранных в PREDAPT, имеет решающее значение для демонстрации его прогностической эффективности при различных типах рака, Гласскок сказал, что данные Culmination дают Cofactor значительные преимущества с точки зрения не только количества образцов пациентов в хранилище, но и времени.

«Нам необходимо знать результаты лечения пациентов от этих методов иммунотерапии [чтобы подтвердить OncoPrism]. Учитывая проспективные данные, которые собираются в рамках PREDAPT, нам приходится месяцами ждать, пока результаты получат полные данные», — сказал Гласскок. «В проспективных исследованиях мы ждем ответа пациентов, и ценность Culmination Bio заключается в том, что у них уже есть образцы пациентов и высококачественные данные о пациентах, собранные и сохраненные. Это позволяет нам действовать гораздо быстрее с помощью наши усилия».

Тест OncoPrism компании Cofactor — это, по сути, платформа для определения иммунного профиля, как описал ее Гласскок. «Мы изучаем наиболее информативные сигнатуры экспрессии генов, которые соответствуют типам иммунных клеток и состояниям иммунных клеток, которые наиболее прогнозируют потенциальных ответчиков и неответчиков на иммунотерапию», — сказал он, пояснив, что платформа OncoPrism, по сути, производит измерения. из этих нескольких аналитов. «Клинические данные нужны для обучения модели, чтобы она говорила нам: «Как выглядит профиль пациентов, ответивших на рак легких? Как выглядит профиль тех, кто не ответил?»

Хотя платформа OncoPrism уже создана, миллионы связанных клинических данных в Culmination Intelligence Platform помогут Cofactor обучить свой тест прогнозированию реакции иммунотерапии при различных типах рака и делать это гораздо быстрее.

На данный момент Cofactor добилась наибольшего прогресса в проверке OncoPrism для прогнозирования того, какие пациенты с раком головы и шеи получат пользу от иммунотерапии, которую Гласскок назвал «плацдармом» фирмы. В сентябре 2022 года компания представила данные, демонстрирующие, что OncoPrism более точно предсказывала пользу анти-PD-1 у пациентов с раком головы и шеи, чем экспрессию PD-L1 на основе иммуногистохимии, которую многие онкологи считают «паршивым биомаркером» для выявления лучших ответчиков на иммунотерапию. . В этом исследовании OncoPrism продемонстрировал 75-процентную точность прогнозирования реакции на ингибиторы иммунных контрольных точек, тогда как иммуногистохимическое тестирование PD-L1 имело 42-процентную точность.

По словам Гласскока, благодаря этим данным Cofactor «хорошо продвигается в борьбе с раком головы и шеи» и стремится коммерциализировать OncoPrism в этих условиях в качестве разработанного в лаборатории теста в «самом ближайшем будущем». Он добавил, что фирма уже работает с врачами по всей стране, чтобы подготовиться к коммерческому выпуску препарата для лечения рака головы и шеи позднее в этом году, а вскоре после этого присматривается к сфере лечения рака легких.